1802801041318028010413深海型海床基主要应用于水深较大的海域，通常在深海平原或水深大于200m的区域。深海型海床基，搭载传感器较多，材料坚固，可抗高压。由于布放深度较大，通常不需要防拖网功能。如INGV设计的GEOSTAR海床基最大布放深度达4000m,平台尺寸长3.5m,宽3.5m,高3.3m,空气中重2.5t,水中重1.4t,可承受30kN的深海压力，主要用于观测海洋环境参数，如温度、盐度、流速等，以及进行海底压力变化的观测。
与浅海型海床基类似，深海型海床基也可以根据具体应用需求分为一般型和特殊型。一般型海床基主要满足基本的海洋环境观测需求，而特殊型海床基则可能具有更高级别的观测和分析功能，例如，对海底热液喷口等特殊环境的观测。
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